1、最后j哥把a哥杀了，后来才知道a哥把他女儿保护在一个地方，j的妻子不是被a哥杀的，是被特种部队员杀的，才知道a哥是好人。
2、本作中主角不再是alex(在本作担任最终boss;邪恶向)，而换成了一个妻子女儿(女儿并未死)双亡誓要杀死alex的特种兵——“james heller”。本作中，alex将heller感染，让其拥有自己的吸收能力，并欺骗heller黑色守望才是幕后主使，是他们杀死heller的亲人，试图利用heller的复仇完成自己的邪恶大计。在heller的劝说下，heller的”神父“选择帮助heller复仇从而消灭幕后主使，并与线人“雅典娜”重新建立联系。
3、在吸收科纳克博士(记不太清楚，就是第一个被杀的进化体)后，主角从记忆中发现其实alex才是幕后主使。从而开始将自己的目标重新转换为alex。不久”神父“被alex的进化体手下杀死。亲之如父的”神父 “死亡，深爱之至的妻子女儿的死亡，让heller的胸腔充满怒火，这时候线人“雅典娜”与heller联系，让heller到红区去找她，并且告诉他，他的女儿并没有死。heller突然联想到自己并未看见女儿的尸体，心中存有希望，赶去红区。
4、赶去红区，找到了线人“雅典娜”，经过一系列交谈，heller得知黑色守望正在准备“火鹰计划”，企图将整个红区肃清，而如果任其如此，会危及到自己在红区某处的女儿。就这样，heller破坏了“火鹰计划”。之后heller便去消灭黑色守望的最高指挥官，但在这过程中，heller从指挥官与他人的通话中得知，指挥官也有自己的妻室和女儿，这让他联想到自己的遭遇，被爱奴隶而不忍下手，最终选择放过指挥官。之后指挥官为了报heller的不杀之恩(也有被父爱感动，与heller产生共鸣的影响)帮助heller找到他的女儿，并掩盖真相杀死了自己的两个手下。但却没想到简塔克的负责人(暂称戈洛瓦) 成为了alex的手下，变成进化体并抢先一步劫持了heller的女儿。亲眼见到女儿被伤害的heller终于爆发，仰天怒吼。alex此时的已经注定灭亡。